La Federación Mexicana de Futbol designó a Rafael Márquez como nuevo director técnico de la Selección Mexicana, tras concluir la etapa de Javier Aguirre. La decisión responde a un plan institucional para dar seguimiento al trabajo realizado durante el último ciclo mundialista.
Después de retirarse como jugador, Márquez inició su preparación como entrenador en España. Su experiencia más relevante fue al frente del Barça Atlètic, donde estuvo cerca del ascenso y consolidó a varios jóvenes talentos que hoy destacan en el futbol europeo.
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Entre los jugadores que ayudó a desarrollar se encuentran Lamine Yamal, Pau Cubarsí, Fermín López, Marc Casadó, Pau Víctor, Héctor Fort, Marc Bernal y Gerard Martín, quienes dieron el salto al máximo nivel tras su paso por el filial blaugrana.
Más tarde se incorporó como auxiliar técnico de Javier Aguirre en la Selección Mexicana. Durante ese proceso conquistó dos Copas Oro de la Concacaf, en 2023 y 2025, además de la Liga de Naciones de la Concacaf, logros que respaldan su llegada como entrenador del Tricolor.

